应用下一代测序来追踪在葡萄牙流传的HIV-1耐药性突变
Victor Pimentel1, Marta Pingarilho1, Cruz S Sebastião1,2,3
1Global Health and Tropical Medicine (GHTM), Associate Laboratory in Translation and Innovation Towards Global Health (LA-REAL), Instituto de Higiene e Medicina Tropical (IHMT), Universidade NOVA de Lisboa (UNL), Rua da Junqueira 100, 1349-008 Lisbon, Portugal.
Viruses
|April 27, 2024
概括
这项研究发现,葡萄牙20%的HIV-1患者有药物耐药性突变 (DRM),传播性耐药性 (TDR) 为12.6%,获得性耐药性 (ADR) 为41.1%. 整合酶链转移抑制剂 (INSTI) 耐药性低但存在.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 全球扩大抗逆转录病毒治疗 (ART) 抑制HIV-1,但不完全的病毒抑制可能导致药物耐药性突变 (DRM).
- 抗病毒药物限制了治疗选择,增加了艾滋病毒传播风险.
- 了解传染性耐药性 (TDR) 和获得性耐药性 (ADR) 对于有效的艾滋病毒管理至关重要.
研究的目的:
- 调查葡萄牙HIV-1患者中TDR和ADR的患病率和模式.
- 评估影响各种抗逆转录病毒药物类别的耐药性突变,包括整合酶链转移抑制剂 (INSTIs).
- 确定与DRM存在相关的因素.
主要方法:
- 在2022年1月至2023年6月期间,对1050名HIV-1患者样本进行了HIV抗药性 (HIVDR) 测试的分析.
- 使用了下一代测序 (NGS) 技术 (Vela诊断 Sentosa SQ HIV-1 基因型鉴定试验).
- 对核酸/逆转录酶抑制剂 (NRTIs),非核酸逆转录酶抑制剂 (NNRTIs),蛋白酶抑制剂 (PI) 和INSTIs进行评估的DRM.
主要成果:
- 总体而言,20%的患者患有DRM;TDR患病率为12.6%,ADR为41.1%.
- 常见的突变包括M184V,T215S,M41L (NRTI),K103N (NNRTI) 和M46I/L (PI).这些突变是最常见的.
- INSTI耐药性较低 (TDR 0.3%,ADR 7%),E138K和R263K在从未接受过ART的患者中更为频繁. 年龄较大,来自葡萄牙语非洲国家 (PALOPs),HIV-1亚型G和低CD4计数与较高的DRM患病率有关.
结论:
- 这项研究为葡萄牙患者的INSTI疗法提供了TDR和ADR的第一个证据.
- 在从未接受过ART的患者中观察到低TDR到INSTI,在暴露于ART的个体中观察到中等水平.
- 基于蛋白酶抑制剂 (PI) 的疗法可以作为显著耐药性患者的替代性二线选择,特别是针对第二代INSTIs.
