[对三种不同的方法进行比较,以调查耐卡巴胺抗性巴曼尼菌的临床分离物分子流行病学]

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 分子流行病学分子流行病学
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 耐卡巴胺的巴曼尼菌 (Acinetobacter baumannii,简称CRAB) 构成了全球严重的健康威胁.
• 国际高风险克隆 (IC I,II和III) 经常与CRAB爆发有关.
• 准确的分子排型方法对于理解CRAB传输动态至关重要.

研究的目的:

• 评估携带碳烯酶基因的CRAB分离物与国际高风险克隆物之间的关系.
• 为了比较不同分子流行病学方法的一致性和区分能力.
• 评估脉冲场凝电泳 (PFGE),多位数序列类型 (MLST) 和矩阵辅助激光吸附/电离飞行时间质谱法 (MALDI-TOF MS) 对于CRAB类型的实用性.

主要方法:

• 使用聚合酶链反应 (PCR) 和DNA测序检测OXA型的碳酶基因 (blaOXA-23,blaOXA-24,blaOXA-51,blaOXA-58).
• 使用PFGE,MLST (帕斯特尔方案) 和MALDI-TOF MS (主要成分分析) 的72个CRAB分离物和参考菌株的分子类型化.
• 使用辛普森多样性指数 (SID) 进行歧视和华莱士系数进行一致的方法的统计比较.

主要成果:

• 所有CRAB分离物都含有blaOXA-23和blaOXA-51基因.
• PFGE确定了五种主要的脉冲型和18种亚型,与国际高风险克隆相关.
• MLST发现了五种序列类型 (ST1,ST2,ST81,ST157,ST604).
• 马尔迪-托夫MS PCA分析显示,与PFGE和MLST相比,他们的歧视能力较低.
• 在 MALDI-TOF MS 和 PFGE/MLST 数据 (华莱士系数) 之间没有发现显著一致.
• PFGE表现出显著的区分能力 (SID),PFGE/MLST一致性显著 (华莱士系数).

结论:

• PFGE和MLST是Acinetobacter baumannii流行病学分析的可靠方法,特别是对于高风险的克隆.
• 目前的PCA申请中,MALDI-TOF MS并不是CRAB流行病学类型的黄金标准,需要改进方法.
• 了解CRAB的分子流行病学对于有效的感染控制策略至关重要.