从2013年到2021年,产生卡巴酶的Morganella spp的传播:一个比较的基因组研究
Rémy A Bonnin1, Elodie Creton2, Amandine Perrin3
1Team Resist UMR1184 Immunology of Viral, Auto-Immune, Hematological and Bacterial Diseases (IMVA-HB), INSERM, Université Paris-Saclay, CEA, LabEx LERMIT, Faculty of Medicine, Le Kremlin-Bicêtre, France; Associated French National Reference Center for Antibiotic Resistance-Carbapenemase-Producing Enterobacteriaceae, Le Kremlin-Bicêtre, France; Bacteriology-Hygiene Unit, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, AP-HP Paris Saclay, Bicêtre Hospital, Le Kremlin-Bicêtre, France.
这项研究提出了摩根氏菌物种的修订分类法,确定了驱动抗菌素耐药性的关键遗传特征. 耐卡巴胺菌株,特别是Morganella morganii,与特定的高风险克隆和耐药机制有关.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
背景情况:
- 摩根氏菌物种是机会性病原体,表现出对多种抗生素,包括菌素的内在耐药性.
- 产生卡巴酶的菌株的出现进一步限制了摩根氏菌感染的治疗选择.
研究的目的:
- 鉴定有助于碳烯耐药摩根氏菌物种传播的遗传特征.
- 根据基因组和表型数据,为摩根氏属提出修订后的分类学.
主要方法:
- 对275种广泛耐药的Morganella spp.进行比较基因组分析. 使用全基因组测序的分离物.
- 对抗菌素敏感性测试,生物化学测试,以及对脂质A的质谱测试.
- 遗传学分析,核心基因组和抗体组的确定,以及基因距离的平均核酸标识 (ANI).
主要成果:
- 建议修改分类,包括四种物种:M.心理耐受性,M. sibonii,M. morganii,以及一个新的环境物种,M. morganii进一步分为两个亚种.
- 产生卡巴酶的菌株主要在M. morganii亚种morganii的五种高风险克隆中发现,NDM-1,KPC-2和OXA-48是最常见的卡巴酶.
- 塞费皮姆-齐德巴克坦对广泛耐药的摩根氏菌有强烈的活性,内在的胆固醇抵抗与L-ARA4N在脂质A上的修饰有关.
结论:
- 澄清摩根氏菌分类学和了解内在耐药性机制对于对抗耐药性感染至关重要.
- 这项研究为未来的基因组比较和开发有针对性的治疗策略提供了基础.
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