一种新的高通量查方法,用于发现癌症丸抗原,使用多omics数据
Dandan Li1, Lingyun Xia2, Xiangang Zhang3
1Department of Stomatology, Taihe Hospital and Hubei Key Laboratory of Embryonic Stem Cell Research, School of Basic Medical Sciences, Hubei University of Medicine, Shiyan 442000, Hubei, China; Laboratory of Tumor biology, Academy of Bio-Medicine Research, Hubei University of Medicine, Shiyan, Hubei, PR China; Shiyan Key Laboratory of Natural Medicine Nanoformulation Research, Hubei University of Medicine, Shiyan, Hubei 442000, China.
一种新的方法使用DNA甲基化和RNA测序来识别癌症/丸抗原 (CTA). 这种方法发现PRSS41,一种血清蛋白酶,通过低甲基化在胃癌中被重新激活,作为潜在的瘤特异性抗原 (TSA) 点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 癌症/丸抗原 (CTA) 具有高度免疫性,并且在瘤中特异性表达,使它们成为癌症免疫疗法和疫苗的理想点.
- 识别新的CTA对于开发有效的癌症治疗至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一个集成的高通量选方法,用于识别新的CTA.
- 应用这种方法来发现胃癌 (GC) 中的CTA.
主要方法:
- 结合DNA甲基化和RNA测序用于多组学分析,以确定转录水平增加和DNA甲基化减少的基因.
- 利用DNA甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂来验证DNA低甲基化和基因表达之间的因果关系.
主要成果:
- 成功开发了一种用于CTA识别的新型高通量选方法.
- 在GC中确定了2000多个候选CTA,其中20个具有显著的组织特异性.
- 发现PRSS41 (一种血清蛋白酶) 是一种新型的CTA,由GC中的促进体DNA低甲基化重新激活,其低甲基化预测了不良预后.
结论:
- 拟议的综合查方法有效地识别了CTA.
- PRSS41是一种新的瘤特异性抗原 (TSA),通过促进体DNA低甲基化在GC中重新激活,代表了潜在的治疗标.
更多相关视频
10:13A Multiplexed Luciferase-based Screening Platform for Interrogating Cancer-associated Signal Transduction in Cultured Cells
Published on: July 3, 2013
11:34Building Up a High-throughput Screening Platform to Assess the Heterogeneity of HER2 Gene Amplification in Breast Cancers
Published on: December 5, 2017