对大米对Xanthomonas oryzae pv.的两阶段反应进行比较的转录基因分析. 奥里齐科拉与两个不同的致病菌株的相互作用

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 植物免疫包括防御反应 (DR) 基因之间的复杂相互作用.
• 细菌叶条 (BLS),是由Xanthomonas oryzae pv.v.引起的 (Xoc),严重威胁到大米的生产.
• 转录组学对于在植物病原体相互作用中识别DR基因至关重要.

研究的目的:

• 在响应Xoc感染时识别大米中的差异表达基因 (DEGs).
• 分析DR基因在病原体相关分子模式 (PAMP) 触发免疫 (PTI) 和效应器触发免疫 (ETI) /效应器触发易感性 (ETS) 中的作用.
• 为了功能性地表征涉及到大米对Xoc.耐药性的DR基因.

主要方法:

• 用RNA测序 (RNA-seq) 来分析易感大米中的基因表达.
• 大米被注射了毒性 (HGA4) 和低毒性 (RS105) Xoc菌株.
• 对DEG进行了基因本体学 (GO) 和基因和基因组京都百科全书 (KEGG) 途径分析.

主要成果:

• 接种后12小时 (hpi) 和接种后3天 (dpi) 观察到基因表达差异.
• 在3dpi时,基因表达变化加剧,与12hpi相比,更多的与疾病相关的途径得到了丰富.
• 确定了四种DR基因 (CDP3.10,LOC_Os11g03820,OsDSR2和OsSPX3),其中三种是积极调节,一个是消极调节米的Xoc.耐药性.

结论:

• 在不同感染阶段,RNA-seq成功识别了与米对Xoc反应相关的DEG.
• 四个DR基因被功能性验证为它们在防治细菌叶条菌对大米免疫力中的作用.