在和PCR查活衰减的沙门氏菌 Typhimurium疫苗菌株

科学领域:

• 食品安全与微生物学
• 兽医公共卫生 兽医公共卫生
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 活体减弱型*沙门氏菌* Typhimurium疫苗对于控制家禽中的*沙门氏菌*至关重要.
• 目前的美国农业部食品安全检查服务 (USDA-FSIS) 标准将所有*沙门氏菌*分离物评为积极的,在检测到疫苗菌株时会对性能指标产生负面影响.
• 区分疫苗和现场菌株对于准确的沙门氏菌监测和监管合规至关重要.

研究的目的:

• 为了确定肉产品中活体减弱*Salmonella*血清Typhimurium疫苗菌株的发病率.
• 开发和验证聚合酶链反应 (PCR) 试验,以区分疫苗菌株与现场菌株.

主要方法:

• 从NCBI病原体检测数据库 (2016-2022) 下载并组装了 *Salmonella* Typhimurium 短读序列.
• 使用基本局部对齐搜索工具 (BLAST) 进行序列分析,比较现场和疫苗菌株特定序列.
• 开发和验证了针对*crp*和*cya*基因中转移事件的PCR试验,以区分菌株.

主要成果:

• 在2016年至2022年期间, *Salmonella* Typhimurium代表了所有来自的 *Salmonella* 隔离物的7.99%; 其中5.97%被确定为疫苗菌株 (104/1708个隔离物).
• 开发的PCR测定成功地使用隔离物区分了Salmonella Typhimurium和疫苗菌株.
• 通过PCR测定,在混合血清夜间丰富培养物中从DNA中检测疫苗菌株的有效性得到了证明.

结论:

• 该研究量化了在家禽产品中检测疫苗菌株的发生率,突出了需要准确区分的需要.
• 开发的PCR试验提供了一种可靠的工具,用于区分活衰减的*Salmonella* Typhimurium疫苗菌株和野外菌株.
• 精确的菌株分化对于有效的沙门氏菌控制策略,监管合规性和公共卫生保护至关重要.