通过使用MS-TDF软件进行三维组合衍生来增强非目标代谢的战略
Caixia Yuan1, Ying Jin2, Hairong Zhang1
1Fujian Provincial Key Laboratory of Innovative Drug Target Research and State Key Laboratory of Cellular Stress Biology, School of Pharmaceutical Sciences, Xiamen University, Xiamen 361005, China.
我们开发了一种新的三维组合衍生策略,用于代谢学. 这种方法提高了代谢物识别的准确性,并减少了质谱数据分析中的假阳性.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生物化学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 化学衍生增强了在质谱学 (MS) 中的代谢物检测,但由于缺乏基准数据库,使数据分析复杂化.
- 非目标代谢学旨在提供全面的代谢物概况,但面临着数据复杂性和解释方面的挑战.
研究的目的:
- 开发一个三维的组合衍生策略,以改善非目标代谢.
- 为了应对基于MS的代谢学中化学衍生所带来的数据挖掘挑战.
- 使用开发的策略,识别肺癌中潜在的碳基生物标志物.
主要方法:
- 使用了三种结构相似的基于化的衍生试剂 (2-hydrazinopyridine,2-hydrazino-5-methylpyridine,2-hydrazino-5-cyanopyridine) 来同时在人体血中衍生碳类型.
- 采用MS-TDF软件,一个内部的MS数据处理工具,用于加速数据分析和衍生化合物的歧视.
- 应用了分析人类血样本的策略,以识别肺癌生物标志物.
主要成果:
- 同时衍生产生了具有稳定,独特的色谱保留时间和质量数的化合物,使MS-TDF能够有效区分.
- 该策略显著提高了人体血样本中的代谢物识别精度.
- 该方法成功地降低了代谢数据分析中错误阳性结果的风险.
结论:
- 三维组合衍生策略提供了一个强大的方法来增强非目标代谢学.
- 这种方法可以更准确地识别代谢物和发现生物标志物,特别是在复杂的生物样本中.
- 开发的战略和支持的MS-TDF软件为推进代谢学研究和临床应用提供了宝贵的工具.
更多相关视频
11:00Untargeted Metabolomics from Biological Sources Using Ultraperformance Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry UPLC-HRMS
Published on: May 20, 2013
05:35An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
Published on: September 20, 2022
相关概念视频
Tandem Mass Spectrometry
Secondary fragmentations occur in the interaction cell and can be induced by various factors. Fragmentation induced by collision with inert gases, such as N2, Ar, He, etc., is called collision-induced...
Peptide Identification Using Tandem Mass Spectrometry
This technique helps gather information regarding the protein from which the peptide was obtained and to study the peptides’ amino acid sequence. Identifying peptides from a complex mixture is an important component of the growing field of...
MALDI-TOF Mass Spectrometry
Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) is a commonly...
Mass Spectrometry: Complex Analysis
GC–MS is a powerful hyphenated method commonly used in forensics and environmental...
¹³C NMR: Distortionless Enhancement by Polarization Transfer (DEPT)
