基于血液的长期低度炎症的全表观基因组分析,跨越多样化的人口队列

科学领域:

• 表观遗传学和分子生物学
• 炎症研究 炎症研究
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 慢性炎症是衰老和疾病的核心,但目前的蛋白质标记物,如C-反应蛋白 (CRP),由于它们的短暂性质而受到限制.
• DNA甲基化 (DNAm) 为评估长期炎症状态提供了一个潜在的更稳定的表观遗传标记.

研究的目的:

• 开发和验证循环C反应蛋白 (CRP) 作为慢性炎症可靠生物标志物的DNA甲基化 (DNAm) 预测剂.
• 评估这些预测因素在不同人群中的表现,并将其与现有的方法和临床措施进行比较.

主要方法:

• 利用弹性网回归和其他先进的算法来构建CRP水平的DNAm预测器.
• 在多个大型群体 (苏格兰一代,LBC1936,ALSPAC,HLS,S2,LBC1921) 中验证的预测因子,具有多样化的人口统计学.
• 对表型变异,现有的DNAm预测因素,遗传分数和26个健康结果进行预测器性能评估.

主要成果:

• 个体间的DNAm差异解释了大型队列中50%的CRP变异 (N=17,936).
• 一个基于弹性网的DNAm预测器解释了CRP中18%的表型变异,超过了以前的预测器.
• 预测者在不同的队列,遗传祖先和年龄组中表现一致,在预测健康结果方面表现优于CRP试验和遗传分数.

结论:

• DNA甲基化特征为评估慢性轻度炎症提供了强大可靠的生物标志物.
• 开发的DNAm预测器为大规模流行病学研究和多样化人群的炎症评估提供了强大的新工具.
• 这些发现为了解和管理由慢性炎症驱动的与年龄有关的疾病开辟了新的途径.