化学领域的适用性评估与现有的雌激素受体高通量测定型活动模型相比
Mark D Nelms1, Todor Antonijevic2, Caroline Ring3
1RTI International, Research Triangle Park, NC, United States.
Frontiers in toxicology
|May 2, 2024
概括
化学聚类有效地评估了选内分泌干扰物的减少测试模型. 一个4个测试模型在各种化学物质中显示出高精度,有助于未来的查策略.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 计算化学是一种计算化学.
- 化学风险评估 化学风险评估 化学风险评估
背景情况:
- 美国环保署的内分泌干扰物查计划 (EDSP) 使用一级测试来识别潜在的内分泌干扰化学物质.
- 一个16个试验模型预测雌激素受体 (ER) 激动性,其中4个试验子集达到高灵敏度 (98%) 和特异性 (92%).
研究的目的:
- 通过化学聚类来评估EDSP化学物质宇宙 (UoC) 的覆盖范围.
- 评估化学聚类在评估一个减少的4试验ER激动模型的实用性.
主要方法:
- 通过CompTox化学品仪表板从EDSP UoC收集了6947种化学结构.
- 根据结构相似性将化学物质分为826个集群.
- 分配ER模型化学品不在UoC中,使用k-最近邻近方法将其分配到集群中.
主要成果:
- 分析了使用化学集的全ER激动剂模型对4个试验模型的性能.
- 4个测试模型在各种化学结构中显示出高精度 (在44个集群中的32个集群中≥90%).
- 确定了122个错误阳性和2个错误阴性,错误阳性经常显示边界活动.
结论:
- 化学聚类有效地说明了EDSP UoC覆盖范围,并有助于评估选方法.
- 4个测试模型在结构多样化的化学物质中表现良好,支持其使用.
- 聚类方法为未来选模型评估和化学品优先级制定提供了一个框架.
