对比表观遗传剖析揭示了与免疫细胞透相关的粘膜黑色素瘤的独特特征及其临床影响
Jie Dai1, Jia Jia2, Fanshuang Zhang2
1Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education/Beijing), Department of Melanoma and Sarcoma, Peking University Cancer Hospital and Institute, Beijing, P.R. China.
Cancer research communications
|May 2, 2024
概括
消化道的原发性恶性黑色素瘤 (PMME) 显示出明显的DNA甲基化模式,包括TERT促进剂高甲基化. 这种表观遗传特征与增加的CD8+T细胞透和PMME患者抗PD-1免疫治疗反应的改善有关.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 粘膜黑色素瘤通常对抗PD-1疗法的反应不佳.
- 消化道的原发性恶性黑色素瘤 (PMME) 是一个显著的例外,对抗PD-1治疗的敏感性更高.
- 这种差异性反应背后的表观遗传机制在很大程度上仍未被探索.
研究的目的:
- 为了研究粘膜黑色素瘤的DNA甲基化场景.
- 为了确定PMME和非食道粘膜黑色素瘤 (NEMM) 之间的表观遗传差异.
- 探索甲基化模式,基因表达,免疫微环境和抗PD-1治疗反应之间的相关性.
主要方法:
- 分析了来自50名粘膜黑色素瘤患者的瘤样本 (31名PMME,19名NEMM).
- 针对DNA甲基化概况的向二硫酸盐测序.
- 大量RNA测序和多重免疫光染色以评估基因表达和免疫透.
主要成果:
- 独特的表观遗传特征使PMME与NEMM有所区别.
- 与NEMM相比,PMME表现出全球高甲基化.
- 一个7-DMR预后模型有效地预测了PMME的整体存活率.
- PMME显示免疫激活细胞增加和TERT促进剂高甲基化,与较高的CD8+T细胞透相关.
- TERT高甲基化与免疫治疗反应的改善有关.
结论:
- 与NEMM相比,PMME拥有独特的甲基化环境.
- 表观遗传分析可以区分粘膜黑色素瘤的亚型.
- TERT促进剂甲基化状态可以作为预后生物标志物,并指导粘膜黑色素瘤的抗PD-1治疗决策.
