描绘了Mycobacterium结核病L4.1.2.1/Haarlem亚系的多药耐药爆发的进化途径

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 进化生物学 进化生物学
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 结核菌菌L4.1.2.1/Haarlem亚系已经与突尼斯北部的多抗药性结核病 (MDR) 爆发有关.
• 疫情发生在没有艾滋病毒同时感染的人群中,这表明病原体的内在传播动态.

研究的目的:

• 调查突尼斯北部M.结核病L4.1.2.1/Haarlem亚系的进化史和传播模式.
• 了解该地区主要的MDR结核病爆发的起源和传播.

主要方法:

• 采用全基因组测序来分析121种对药物敏感和耐药的L4.1.2.1/Haarlem临床菌株.
• 用贝叶斯的方法重建了进化轨迹,并估计了菌株的分歧时间.
• 基因组数据分析了来自疫情地区的16年 (2001-2016) 的基因组数据.

主要成果:

• L4.1.2.1/Haarlem亚系表现出快速传播的高度倾向,由高集群率 (44.6%) 和最近的传播事件 (25%) 证明.
• 这些MDR结核菌株与两个不同的疫情有关:一个主要的疫情涉及68人 (2001-2016),一个较小的,新发现的疫情涉及6例病例 (2001-2011).
• 遗传学分析表明,这两种疫情都独立地起源于一个共同的祖先,可以追溯到大约1886年.

结论:

• 结核菌L4.1.2.1/Haarlem亚系在突尼斯北部具有快速传播的内在能力.
• 该地区的MDR结核流行病可追溯到单一的祖先菌株,这强调了细菌的遗传构成的重要性.
• 了解驱动成功的MDR M.结核克隆的遗传因素对于控制结核传播至关重要.