转录组分析显示SMURF2是口腔癌的预后生物标志物
Lu Deng1,2,3, Zhihong Wu4, Chuanxi Sun1,2,3
1The Affiliated Stomatological Hospital, Jiangxi Medical College, Nanchang University, Nanchang, Jiangxi Province, 330006, China.
Journal of applied genetics
|May 2, 2024
概括
这项研究确定了8个TGF相关基因 (TRG),用于预测口腔癌存活率和免疫状态. 基因SMURF2是一个关键的预后生物标志物,显示其表达与瘤免疫微环境之间的联系.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 转化生长因子-β (TGF-β) 途径的激活促进了瘤发生.
- 在口腔癌中了解TGF相关基因 (TRGs) 对预后至关重要.
研究的目的:
- 使用TRG开发口腔癌的预后模型.
- 确定关键的TRG和生物标志物,用于预测患者的存活率和免疫状态.
主要方法:
- 拉索回归和多变量COX回归用于预后模型开发.
- 定量实时聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 和人类蛋白质图谱 (HPA) 用于SMURF2验证.
- 单样样本基因组丰富分析 (ssGSEA) 用于评估免疫细胞透.
主要成果:
- 在口腔癌中确定了16个上调的TRG,其中8个被选为预后特征.
- 开发了一个8-TRG风险模型,将患者分为高风险和低风险组.
- 发现SMURF2作为一个独立的预后生物标志物,在口腔癌上调并与免疫微环境特征相关.
结论:
- 8-TRG签名有效预测口腔癌患者的存活率和免疫活性.
- 在口腔癌中,SMURF2显示出作为预后和评估免疫疗效的生物标志物的潜力.
