在1型干扰素路径基因中的单核酸多态性和人类免疫缺陷病毒1型病毒载量之间的关联在未经抗逆转录病毒治疗的参与者中
Sara Bohnstedt Mørup1, Preston Leung1, Cavan Reilly2
1Centre of Excellence for Health, Immunity, and Infections, Copenhagen University Hospital, Rigshospitalet, Copenhagen, Denmark.
AIDS research and therapy
|May 2, 2024
概括
1型干扰素 (IFN) 基因的遗传变异,特别是IFNW1,在早期感染中显示出与HIV-1病毒载荷的边界关联. 在对人口结构进行控制后,这种联系没有显著意义,这表明通过这种途径对艾滋病毒进展的遗传影响有限.
科学领域:
- 免疫遗传学 免疫遗传学
- 病毒学 病毒学
- 人类遗传学 人类遗传学
背景情况:
- 人类遗传因素不足以解释人类免疫缺陷病毒 (HIV) 的进展.
- 1型干扰素 (IFN) 途径在宿主控制HIV中起着至关重要的作用.
- 1型IFN基因中的遗传变异可能会影响艾滋病毒疾病的进展.
研究的目的:
- 评估1型IFN基因和HIV-1病毒载荷 (VL) 途径中的遗传变异对HIV-1病毒载荷 (VL) 的影响.
- 调查与HIV-1病毒载量相关的1型IFN的基因和通路水平变异.
主要方法:
- 对两组 (START和FIRST) 接受抗逆转录病毒疗法 (ART) 的艾滋病毒感染者 (PLWH) 的前不见人群进行分析.
- 检查17种1型IFN基因和受体子单元 (IFNAR1,IFNAR2) 用于途径和个体基因分析.
- 使用SKAT-O检测基因型-HIV-1病毒载量关联,对P值进行Bonferroni校正 (P<0.0025).
主要成果:
- 在19个1型IFN基因中的673个SNP中没有发现有意义的关联,在START队列中 (n=2429) 具有研究项VL的1型IFN基因.
- 在START队列中,IFNW1和研究项VL之间观察到边界显著的关联 (P=0.0025),在使用线性混合效应模型 (LME) 控制人口结构后失去意义.
- 在IFNW1中单核酸多态 (SNP) rs79876898与更高的研究入口VL (β=0.32) 相关,但这一发现没有在FIRST队列中复制.
结论:
- 只有IFNW1基因在早期感染的ART-naïve个体中显示出与HIV-1病毒载荷的潜在关联.
- 这种关联并不强大,在计算人口结构时变得无关紧要.
- 这项研究表明,1型IFN基因的变异对研究队列中的HIV-1病毒载量有有限的影响.
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