在Crocus sativus中对尺寸依赖的开花承诺进行转录组分析,对角丰富的芽样本进行了转录组分析,揭示了糖和auxin信号传递的作用

科学领域:

• 植物科学 植物科学
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 番石榴 (Crocus sativus) 的种植受不一致的开花和产量所限制,受大小的影响.
• 较小的花不能开花,需要研究大小依赖的开花启动的遗传基础.

研究的目的:

• 鉴定Crocus sativus中依赖大小的开花背后的遗传机制.
• 为了比较不同大小的花中的开花和非开花的顶角芽之间的基因表达特征.

主要方法:

• 来自小 (<6 g) 和大 (>14 g) Crocus sativus corms 的顶端芽样本的RNA测序.
• De novo转录组组合和差异性基因表达分析.
• 使用Arabidopsis thaliana对应物进行蛋白质与蛋白质相互作用分析.

主要成果:

• 基因表达分析揭示了粉/糖代谢,auxin和酸 (ABA) 在开花承诺中的重要作用.
• 关键的基因,如开花地点T (FT) 和加密染色体1 (CRY1),以及小辅酶上调调的RNA (SAUR) 转录,显示在开花的芽中诱导表达.
• 预测了Crocus sativus的非编码RNA谱,并确定了埃诺酶是主要的蛋白质相互作用中心.

结论:

• 参与烯胺生物合成,激素信号传递和碳代谢的转录因花大小和开花而显著调节.
• 基因表达路径分析和蛋白质与蛋白质相互作用数据支持基因表达的发现.
• 这项研究阐明了控制沙夫兰大小依赖的开花的关键遗传决定因素.