在食品和水样本中检测环菌:从监管机构的角度来看,针对特定和敏感分子方法的优化协议
Mauricio Durigan1, Laura Ewing-Peeples1, Sonia Almeria1
1U.S. Food and Drug Administration, Center for Food Safety and Applied Nutrition, Office of Applied Research and Safety Assessment, Division of Virulence Assessment, Laurel, MD 20708, USA.
Journal of food protection
|May 3, 2024
概括
新的分子标记物改善了对Cyclospora cayetanensis的检测,这是一种导致胃肠道疾病的寄生虫. 优化的实时PCR分析提高了在农产品和水中检测这种病原体的特异性,有助于疫情调查.
科学领域:
- 寄生虫学的寄生虫学
- 分子生物学分子生物学
- 食品安全 食品安全
背景情况:
- 赛克洛斯波拉 (Cyclospora cayetanensis) 是导致人类胃肠道疾病 - - 赛克洛斯波拉症的原因.
- 传染性需要环境暴露卵,使人与人之间的直接传播复杂化.
- 准确的检测方法对于解决数据缺口和支持疫情调查至关重要.
研究的目的:
- 为检测C. cayetanensis开发更具体的分子标记物.
- 优化定性实时PCR测定,以提高特异性和灵敏度.
- 确定用于在农产品和水中检测C. cayetanensis的替代试剂和方法.
主要方法:
- 利用更新的Apicomplexa线粒体基因组数据库来识别新的分子标记物.
- 设计并测试了Mit1C原料和探头,评估对相关物种的特异性.
- 优化了产品和农业用水样本的定性实时PCR测定,包括样本处理和试剂修改.
主要成果:
- Mit1C原料和探针显示至少有13种与相关物种不匹配,这表明特异性很高.
- 优化的实时PCR测定显示了与先前验证的方法相比的灵敏度.
- 该研究确定了用于检测C. cayetanensis在农业用水中的替代试剂和改进的方案,包括取代已停产的物品.
结论:
- 与以前的方法相比,新的Mit1C实时PCR试验为C. cayetanensis的检测提供了更高的特异性.
- 该测试是稳固的,并保持灵敏度,使其适合监管使用.
- 这项研究扩大了可用的PCR试剂,并改善了C. cayetanensis在食品和水安全监测中的检测方法.
