NP³ MS 工作流:一个开源软件系统,以授权基于天然产品的药物发现,使用非目标代谢学

科学领域:

• * 化学和生物学界面接口
• * 药物发现和开发
• * * 自然产品研究

背景情况:

• *天然产品是新药的主要来源.
• *目前的药物发现需要高通量方法,与传统的天然产品研究不兼容.
• * 需要有效的工具来分析复杂的天然产品混合物.

研究的目的:

• * 介绍NP3 MS工作流程,这是一个开源软件,用于分析非目标代谢数据.
• * 能够从复杂的混合物中直接排序生物活性天然产品.
• * 促进融入基于天然产品的药物发现管道.

主要方法:

• *开发一个强大的开源软件系统,用于液体染色学-双重质谱 (LC-MS/MS) 数据处理.
• * 实现最小的用户干预,可定制LC-MS/MS数据处理步骤.
• * 纳入诊断统计数据的数据解释和优化.
• * MS2光谱的高级计算,自动离子解卷,结构注释和前体离子定量.

主要成果:

• * NP3 MS 工作流程使复杂混合物中的生物活性天然产品能够有效分析和排名.
• * 该软件提供了改进的MS2光谱计算和使用碎片化规则的自动解卷.
• * 包含与MS2数据库进行结构注释和生物活性相关性相对定量化的工具.
• *案例研究和比较证明了软件的稳定性和实用性.

结论:

• * NP3 MS 工作流提供了一种强大而有用的方法,用于从复杂样本中选择生物活性天然产品.
• * 该软件增强了针对非目标代谢学的工具包.
• * 它可以很容易地集成到天然产品药物发现和其他化学生物学研究领域.