通过外显子水平表达,发现了针对儿科固体和脑瘤的免疫疗法标

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 免疫治疗是一种免疫疗法.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 对儿科固体和脑瘤的化学抗原受体T细胞 (CAR-T) 免疫疗法受限于适合的向抗原的稀缺性.
• 癌症特异性外代表着高度特异性的瘤标的未经探索的来源.
• 缺乏对这些外因子标进行系统的泛癌验证.

研究的目的:

• 系统地识别和验证儿科固体和脑瘤的癌症特异性外因子标.
• 开发针对这些已识别的抗原的新型CAR-T细胞疗法.

主要方法:

• 分析了来自16种儿科瘤类型的1532个RNA测序数据集,与使用新型生物信息学工作流程的正常组织进行比较.
• 识别编码表面体或母体体蛋白质的基因,具有癌症特异性外型.
• 在患者衍生异种移植模型中验证选择的标 (例如,纤维素1 EDB 域, COL11A1).
• 产生和测试针对验证的抗原的CAR-T细胞.

主要成果:

• 在157个基因中发现了2933个癌症特异性外原体,在基因 (148个基因) 或替代拼接异型 (9个基因) 层面具有高特异性.
• 在儿科异种移植瘤中对选择的替代拼接和基因标的表达的验证.
• 通过改造以准纤维素1 EDB 域或 COL11A1.1. 的 CAR-T 细胞来证明抗瘤活性.

结论:

• 已经确定了癌症特异性外子标的全面清单,为儿科固体和脑瘤免疫治疗提供了有前途的资源.
• 开发的交互式网络门户网站为探索这些新目标提供了一个可访问的平台.
• 向癌症特异性外因子是提高儿童癌症中CAR-T细胞疗法的疗效和特异性的可行策略.