汇集气管样本测试对检测Mycoplasma hyopneumoniae的概率的影响
Ana Paula Serafini Poeta Silva1, Robert Mugabi1, Marisa L Rotolo2
1Veterinary Diagnostic and Population Animal Medicine, Iowa State University, Ames, IA, USA.
Scientific reports
|May 3, 2024
概括
将气管样本用于Mycoplasma hyopneumoniae (M. hyopneumoniae) 的DNA检测进行组合,可以降低成本. 这项研究发现,将最多10个样本组合在一起,可以保持M. hyopneumoniae监测的高灵敏度和检测概率.
科学领域:
- 兽医诊断 兽医诊断 兽医诊断 兽医诊断
- 分子流行病学分子流行病学
- 猪病监测 猪疾病监测
背景情况:
- 菌性肺炎 (M. hyopneumoniae) 是猪的重要呼吸道病原体.
- 高昂的诊断成本是有效的M. hyopneumoniae监测计划的一个主要限制.
- 气管样本的组合提供了一种潜在的策略,可以降低成本,同时保持诊断的准确性.
研究的目的:
- 估计用于检测M. hyopneumoniaeDNA的汇集气管样本的诊断灵敏度.
- 在由3,5和10组合的气管样本中开发M. hyopneumoniae检测估计的概率.
- 为了评估在M. hyopneumoniae监测中聚合测试的成本效益.
主要方法:
- 收集了M. hyopneumoniae的PCR阳性和阴性现场样本.
- 通过组合3,5和10个个体气管样本,创建聚合样本.
- 使用PCR测试三份组合样本,并计算检测灵敏度和检测概率.
主要成果:
- 3,5和10个池的灵敏度分别估计为0.96,0.95和0.93.
- 如果单个样本Ct值<33,所有池大小都检测到M.hyopneumoniae.
- 在所有池的大小中,检测至少一个感染猪的概率没有显著下降.
结论:
- 气管样本组合是M. hyopneumoniae监测的一个敏感且具有成本效益的方法.
- 聚合允许增加抽样数量,提高监控计划的整体性能.
- 这一策略可以显著降低诊断成本,而不会影响M. hyopneumoniae的检测概率.
