通过使用多重重组合酶聚合酶放大剂在牛鼻抽样中改善整合性结合元件的检测
Cheyenne C Conrad1, Tara Funk2, Sara Andrés-Lasheras1
1Agriculture and Agri-Food Canada, Lethbridge Research and Development Centre, Lethbridge, AB T1J 4B1, Canada.
Journal of microbiological methods
|May 5, 2024
概括
一种新的双重复合聚合酶增强 (RPA) 试验检测了牛中携带抗菌素耐药基因的整合性和结合性元素 (ICE). 该工具有助于早期识别抗菌素耐药性牛呼吸系统疾病的风险因素.
科学领域:
- 兽医微生物学 兽医微生物学
- 分子诊断学 分子诊断
- 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性
背景情况:
- 牛呼吸道疾病 (BRD) 在全球范围内带来了重大经济挑战.
- 与BRD相关的细菌中的整合性和结合性元素 (ICEs),如曼海米亚血清菌,帕斯图雷拉多菌和Histophilus somni,有助于抗菌素耐药性 (AMR).
- ICE 获得抗菌素耐药性基因 (ARG) 损害了治疗的有效性.
研究的目的:
- 开发一种快速准确的分子诊断工具,用于检测特定的ICE变异.
- 确定与养场牛抗微生物耐药性BRD相关的潜在风险因素.
主要方法:
- 开发一个双重实时多重复合重组聚合酶放大 (RPA) 试验.
- 针对两个ICE变异,tetH_tnpA和tetH_ebrB,与保留的ARG tet(H) 相关.
- 通过使用全基因组测序和对100头牛鼻抽样DNA的测试进行验证.
主要成果:
- 双重RPA测定证明了ICE检测的高灵敏度和准确性.
- 检测的极限是tetH_tnpA的29个基因组副本和tetH_ebrB的38个基因组副本.
- 该试验成功地在养场牛的现场样本中发现了ICE.
结论:
- 开发的实时多重RPA测定是一种有价值的分子工具,用于及时检测ICE.
- 这种测试可以帮助识别面临发展抗菌素耐药性BRD风险的牛.
- 早期检测有助于采取积极的管理策略,以减轻料区的抗菌耐药性传播.
