基于韩国野生动物的copro-DNA分析,对病原性寄生虫进行metabarcoding

科学领域:

• 兽医寄生虫学 兽医寄生虫学
• 野生动物生态生态学
• 分子诊断学 分子诊断

背景情况:

• 韩国占主导地位的野生动物物种,包括猫,犬,水鹿和野猪,可以作为传染病原体的储存库.
• 了解这些野生动物群体中的寄生动物群对于监测和控制动物传染病原体的潜在传播至关重要.

研究的目的:

• 用分子方法识别和鉴定感染韩国关键野生动物物种的虫和原生动物群体.
• 为了在未来的流行病学监测中建立对野生动物群体寄生虫检测的基线.

主要方法:

• 便样本从韩国平,洪和阳地区的51只野生动物中收集.
• 18S rRNA基因V9超变区的元编码被用于高通量寄生虫识别.
• 分析了序列数据,以检测来自各种寄生虫种群的遗传物质.

主要成果:

• 线虫包括 *Metastrongylus* sp., *Strongyloides* spp., *Ancylostoma* sp. 和 *Toxocara* sp. 这三种类型. 已经被检测到.
• 平甲虫如 *Spirometra* sp., Echinostomatidae 属. 这种类型的甲虫. sp. , *Alaria* sp. , *Neodiplostomum* sp. , 和 *Clonorchis* sp. 这两种类型的虫. 已经确定了.
• 原生动物包括 *Entamoeba* sp. , *Blastocystis* sp. , *Isospora* sp. , *Tritrichomonas* sp. , *Pentatrichomonas* sp. 和 *Cryptosporidium* sp. 这三种类型的生物. 在便样本中发现.

结论:

• 18S rRNA V9区域的元编码是识别野生动物群体中广泛的寄生虫的有效工具.
• 这些发现突显了韩国野生动物中多样化的寄生虫感染,强调了动物传播疾病预防监测的重要性.
• 这种分子方法为持续监测野生动物健康和潜在的病原体传播提供了有价值的方法.