使用单细胞转录组和蛋白质组成像绘制人类骨髓的细胞生物地理

科学领域:

• 血液学
• 细胞生物学
• 基因组学
• 空间生物学

背景情况:

• 非造血细胞对于血液的形成至关重要 (造血).
• 它们在人类骨髓中的多样性和空间布局尚不清楚.
• 了解这些细胞是解读血液形成的关键.

研究的目的:

• 描述人类骨髓中非造血细胞的异质性和空间组织.
• 绘制影响血液形成的细胞相互作用.
• 鉴定与急性髓性白血病 (AML) 相关的骨髓空间变化.

主要方法:

• 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 用于分析非造血细胞和造血细胞.
• 通过索引 (CODEX) 共同检测超过120万个单元的空间概况.
• 整合scRNA-seq和CODEX数据以将信号与空间接近联系起来.

主要成果:

• 确定了九种不同的非造血细胞亚型.
• 揭示了早期骨髓形成的高氧化动脉内骨.
• 发现早期造血干细胞和前代细胞 (HSPC) 的脂肪细胞局部化.
• 在AML患者样本中发现了介质层细胞 (MSC) 的扩张和特定的空间区域.

结论:

• 开发了人类骨髓的空间解析,多原子图谱.
• 这本地图书作为研究细胞相互作用的参考.
• 在AML中确定了不同的细胞和空间变化,突出显示了MSC的作用.