维拉软件:实施急性鱼类毒性终点及其对药物化合物的应用
Erika Colombo1, Edoardo Luca Viganò1, Giuseppa Raitano1
1Laboratory of Environmental Toxicology and Chemistry, Department of Environmental Health Sciences, Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri IRCSS, Milano, Italy.
虚拟广泛阅读软件 (VERA) 现在可以预测持续的终点,如急性鱼类毒性. 这种计算毒理学工具可以对物质和活性药物成分进行可靠的预测.
科学领域:
- 计算毒理学计算毒理学
- 化学信息学 化学信息学
- 环境风险评估环境风险评估
背景情况:
- 交叉阅读是一种用于预测物质性质的方法.
- 虚拟广泛阅读软件 (VERA) 以前用于分类终点,如致癌性.
- 评估连续终点需要扩展现有的跨读方法.
研究的目的:
- 将使用VERA的自动读横方法扩展到连续端点.
- 评估VERA在预测急性鱼类毒性方面的表现.
- 评估VERA对活性药物成分 (API) 的适用性.
主要方法:
- 使用了VERA,包括全球相似性得分,分子组和结构警报.
- 将VERA应用于一般物质数据集,用于对鱼类的急性毒性预测.
- 评估了VERA的活性药物成分,包括一些在培训套件中.
主要成果:
- 在一般物质的急性鱼类毒性预测中获得了0.68的R2.
- 在预测活性药物成分 (API) 时获得了0.63的R2.
- 预测的可靠性很高,R2为0.78和RMSE为0.44.
结论:
- 可以成功地将VERA扩展到评估连续终点,例如急性鱼类毒性.
- 在预测一般化学品和API的特性方面,VERA算法显示出有前途.
- 维拉的可靠性评估对于可靠的计算毒理学预测至关重要.
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