鱼肠道微生物组的元分析:多样性,共同进化和与人类致病生物组的相互作用
Elena Radaelli1, Giorgia Palladino1, Enrico Nanetti2
1Unit of Microbiome Science and Biotechnology, Department of Pharmacy and Biotechnology (FaBiT), Alma Mater Studiorum - University of Bologna, Via Belmeloro 6, 40126 Bologna, Italy; Fano Marine Center, The Inter-Institute Center for Research on Marine Biodiversity, Resources and Biotechnologies, Viale Adriatico 1, 61032, Fano, Italy.
The Science of the total environment
|May 7, 2024
概括
鱼的肠道微生物因宿主进化和饮食而异,对寄生虫有弹性. 这些海洋哺乳动物是生态系统健康和人类影响的关键生物指标.
科学领域:
- 海洋生物学 海洋生物学
- 微生物组研究 微生物组研究
- 进化生物学 进化生物学
背景情况:
- 关于鱼肠道微生物组 (GM) 的研究有限.
- 类动物是具有独特进化路径的顶级捕食者,是共生研究和海洋健康指标的理想模型.
- 了解转基因对海洋生态系统健康评估至关重要.
研究的目的:
- 为了研究8种鱼 (Odontocetes和Mysticetes) 的肠道微生物组合.
- 为了探索宿主基因,饮食和环境因素对鱼GM的影响.
- 评估原生动物寄生虫对 GM 类动物的影响及其作为生物指标的作用.
主要方法:
- 来自自由活动的鱼的便样本的16S rRNA向的安普利康测序.
- 来自地中海佩拉戈斯保护区 (Pelagos) 的样本分析.
- 包括公开可用的鱼转基因序列数据.
主要成果:
- 观察到一个明确的肠道微生物组轨迹,与宿主系谱和分类学 (细胞共生) 有关.
- 显著的转基因变异表明,有牙的和的鱼之间适应了不同的饮食.
- 原生动物寄生虫感染,可能是人类起源的,是常见的,但没有导致严重的转基因生物失调.
结论:
- 宿主基因和饮食是塑造 GM 鱼的主要驱动因素.
- 中性过程和环境因素也在转基因宿主共生中起作用.
- 鱼作为生物指标,寄生虫的存在凸显了人类对海洋生态系统的影响.
