鉴定急性髓性白血病中预后基因的微环境:生物信息和实验分析
Ali Keshavarz1, Amir Abbas Navidinia1, Bentol Hoda Kuhestani Dehaghi1
1Department of Hematology and Blood Banking, School of Allied Medical Sciences, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, P.O. Box: 15468-15514, Tehran, Iran.
Molecular biotechnology
|May 7, 2024
概括
生物信息学分析确定了影响急性髓性白血病 (AML) 患者存活率的关键微环境相关基因. 这些基因有可能成为AML的预后和治疗标.
科学领域:
- 血液学 血液学 血液学
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 急性髓性白血病 (AML) 的预后受到骨髓微环境的显著影响.
- 了解AML微环境对于改善诊断,风险评估和定制治疗至关重要.
- 生物信息学为剖析癌症复杂性提供了强大的工具.
研究的目的:
- 确定与AML患者存活相关的微环境相关基因.
- 利用公共数据库探索这些基因的预后价值.
- 在AML患者中验证顶级预后基因的表达.
主要方法:
- 利用TCGA基因表达数据库和来自173名AML患者的临床数据.
- 应用了xCell算法来计算微环境分数 (MS).
- 在GEO数据库中进行了差异基因表达分析,生存相关性 (无变Cox) 和验证.
主要成果:
- 在AML中鉴定了716个差异表达基因 (DEGs).
- 152 DEGs与患者存活率有显著的相关性.
- 31个候选基因的预后值得到证实;FLVCR2,SMO和CREB5的表达在AML患者和对照人群之间有显著差异.
结论:
- 确定了影响AML患者存活率的关键微环境相关基因.
- FLVCR2,SMO和CREB5被突出显示为潜在的预后生物标志物.
- 这些基因代表了未来AML治疗策略的有希望的目标.
