建立实时光定量PCR检测方法,并对BoAHV-1进行基因分析
Lihui Xu1, Guiyang Ge1, Dongli Li1
1College of Animal Science and Technology, Jilin Agricultural University, Changchun, 130118, Jilin, China.
BMC veterinary research
|May 7, 2024
概括
一种新的实时PCR方法可以准确检测由Bovine alphaherpesvirus-1 (BoAHV-1) 引起的传染性牛鼻炎 (IBR). 基因分析确定了孤立的JL5菌株为BoAHV-1.1,有助于疾病控制.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 牛感染性鼻炎 (IBR),由牛αherpesvirus-1 (BoAHV-1) 引起,是一种传染性牛病,造成重大经济损失.
- 准确和快速检测BoAHV-1对于疾病管理和控制至关重要.
研究的目的:
- 开发一种敏感和特定的实时光定量PCR (qPCR) 方法来检测BoAHV-1.
- 从临床样本中分离和基因鉴定BoAHV-1菌株.
主要方法:
- 开发基于SYBR Green II的BoAHV-1实时qPCR测定方法.
- 来自牛的临床鼻样本的测试.
- 隔离和基因分析 (gC,TK,gG,gD,gE基因) 的BoAHV-1分离物.
- 同类学和遗传学树分析.
主要成果:
- 实时qPCR方法实现了7.8 × 10 1 个DNA拷贝/μL的检测极限,具有出色的特异性和可重复性.
- 17.44% (15/86) 的临床样本呈阳性,检测率高于传统PCR.
- 隔离的JL5菌株与BoAHV-1.1基准菌株具有很高的相似性,在Cg,TK,gG基因中发现了特定的氨基酸突变.
- 遗传学分析将JL5菌株置于BoAHV-1.1基因型中,与美国菌株密切相关.
结论:
- 开发的实时qPCR方法对BoAHV-1检测具有敏感性,特异性和可重复性.
- 已分离的JL5菌株被确定为BoAHV-1.1,为了解其遗传演变提供了有价值的数据.
- 这些发现支持改善牛群IBR的检测,预防和控制策略.
