在Salmonella enterica的多个血清体中存在菌体
Satheesh Nair1, Clare R Barker1,2, Matthew Bird1,3
1UK Health Security Agency, London, UK.
Microbial genomics
|May 8, 2024
概括
在沙门氏菌中,传播抗微生物药物耐药性基因的菌体元素比以前认为的更为常见. 这项研究选了超过47,000个分离物质,在226个中发现了这些元素,突出了它们在抗性基因转移中的作用.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 基因的传播是一个日益严重的公共卫生问题.
- 细菌体和相关元素 (体等离子体) 越来越多地被认为是水平基因转移的媒介.
- 在肠道细菌,特别是沙门氏菌中菌体的流行率仍然被低估.
研究的目的:
- 系统地评估英国沙门氏菌分离物中菌体的流行率和特征.
- 调查菌体与特定的沙门氏菌血清和序列类型的关联.
- 了解已识别的体等离子体的多样性和遗传特征.
主要方法:
- 使用高通量生物信息学管道对47784个英国沙门氏菌分离物 (2016-2021) 的回顾性分析.
- 查P1光学复制基因 (repL) 以确定潜在的菌体等离子体元素.
- 积极分离的详细基因组分析,包括大小,基因含量和复制类型.
主要成果:
- 在47784个沙门氏菌分离物中,有226个含有菌体等离子体元素,这表明其频率高于以前的假设.
- 菌体的存在依赖于血清,沙门氏菌Typhimurium ST34和ST19是最常见的宿主.
- 鉴定到的形质粒在尺寸 (85.898.2 kb) 和基因含量上有所不同,其中p0111和IncY复制类型是常见的.
结论:
- 菌体在沙门氏菌中普遍存在,并且可能对AMR基因的水平传播作出重大贡献.
- 监测策略应包括对菌体的检测和表征,特别是使用长读测序.
- 需要进一步的研究,才能充分了解菌体对抗菌素耐药性动态的流行病学影响.


