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Updated: Jun 26, 2025
10:16
Assessing Stem Cell DNA Integrity for Cardiac Cell Therapy
Published on: January 25, 2019
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在配对的新鲜,冷和甲固定嵌心脏组织中评估DNAmAge
Paulina Pruszkowska-Przybylska1, Mikkel Eriksen Dupont2, Stine Bøttcher Jacobsen2
1Department of Anthropology, Faculty of Biology and Environmental Protection, University of Łódź, Łódź, Poland.
PloS one
|May 8, 2024
概括
组织存储方法显著影响DNA甲基化年龄 (DNAmAge) 估计. 与新鲜或冷样本相比,固定甲嵌入 (FFPE) 组织的DNAmAge被低估,因此需要特定的模型来准确预测年龄.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 基因组分析 基因组分析
- 生物遗传学 生物遗传学
背景情况:
- DNA甲基化分析提供了对生物和时间年龄的精确见解.
- 组织处理和储存方法可以影响DNA甲基化分析结果.
- 组织储存对DNA甲基化年龄 (DNAmAge) 估计的影响在很大程度上仍未被描述.
研究的目的:
- 研究常见组织存储方法 (冷和FFPE) 对DNAmAge估计的影响.
- 为了比较不同存储条件下从心脏组织中提取的DNAmAge与时间年龄和全血DNAmAge.
- 评估各种表观遗传钟在不同样本类型和储存方法的年龄预测中的可靠性.
主要方法:
- 分析了来自新鲜,冷和FFPE储存的配对心脏组织样本.
- 使用Illumina EPIC珠芯片阵列进行了DNA甲基化分析.
- DNAmAge是使用十个已建立的表观遗传时钟 (Horvath,Hannum,Levine,Horvath2,PedBE,Wu,BLUP,EN,TL) 来计算的.
主要成果:
- 在储存条件之间观察到DNAmAge的显著差异.
- 与新鲜和冷样本相比,FFPE保存的心脏组织的DNAmAge较低.
- 心脏组织DNAmAge通常低于全血和时间年龄.
结论:
- FFPE样本的储存导致DNAmAge的低估,需要谨慎的解释.
- 准确的DNAmAge估计需要特定于存储方法的表观遗传时钟模型.
- 针对心脏组织的专用DNAmAge预测模型对于可靠的年龄评估至关重要.
