抽象查任务的机器学习模型 - 一个系统的文献审查应用程序,用于健康经济学和结果研究
Jingcheng Du1, Ekin Soysal1,2, Dong Wang3
1Intelligent Medical Objects, Houston, TX, USA.
这项研究开发了针对人类乳头瘤病毒 (HPV) 和肺炎球菌相关儿科疾病 (PAPD) 的特定疾病体,以自动化系统文献审查 (SLR) 查. 深度学习模型在高效的SLR抽象选方面显著优于传统的机器学习.
科学领域:
- 生物医学信息学 生物医学信息学
- 计算生物学 计算生物学
- 医学研究 医学研究
背景情况:
- 系统性文献审查 (SLR) 对生命科学至关重要,但受到手动数据选择的阻碍.
- 在SLR中自动化抽象选过程可以显著加速研究.
- 开发针对特定疾病领域的专门工具可以提高审查效率.
研究的目的:
- 为人类乳头瘤病毒 (HPV) 和肺炎球菌相关的儿科疾病 (PAPD) 创建注释体.
- 优化机器学习 (ML) 和深度学习 (DL) 模型,用于自动化的单反相机抽象选.
- 提高识别相关研究出版物的效率和准确性.
主要方法:
- 用引用元数据和摘要构建两个特定疾病的体 (HPV和PAPD).
- 使用精度,回忆,准确性和F1分数等指标评估ML和DL算法.
- 包括诸如关键字和医学主题标题 (MeSH) 等特征来提高模型性能.
主要成果:
- 在HPV群体包括1697条目 (538相关),和PAPD群体有2865条目 (711相关).
- 结合额外的功能,ML模型的准确性提高了3% (HPV) 和2% (PAPPD).
- 基于变压器的DL模型比传统的ML算法表现出更高的性能.
结论:
- 针对特定领域的预训练语言模型显示出SLR抽象选的重大前景.
- 开发的 corpora 和优化模型为智能单反相机系统提供了基础.
- 使用先进的ML/DL技术进行自动查可以加快关键生命科学研究.
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