一种食鸟蝙蝠物种 (Nyctalus aviator) 的染色体级基因组组合
Yang Geng1, Yingying Liu1, Yu Zhang2
1Jilin Provincial Key Laboratory of Animal Resource Conservation and Utilization, Northeast Normal University, Changchun, 130117, China.
Scientific data
|May 10, 2024
概括
一个新的参考基因组的食鸟蝙蝠,尼克塔卢斯飞行员,被测序. 这种基因组为肉食蝙蝠的分子适应提供了关键的见解,它们具有扩大的食.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 进化生物学 进化生物学
- 动物学 动物学
背景情况:
- 已知有三种蝙蝠物种,包括Nyctalus飞行员,捕食候鸟,称为食鸟蝙蝠.
- 由于缺乏这些物种的参考基因组,因此无法理解它们对这种独特饮食的分子适应.
研究的目的:
- 为了生成一个高质量的,染色体规模的基因组对尼克塔卢斯飞行员.
- 促进对食鸟蝙蝠的适应性和它们的食利基扩张的研究.
主要方法:
- 使用PacBio子读数,DNBSEQ短读数和Hi-C测序数据进行基因组组装.
- 进行了基因组组装,脚手架,基因预测和功能注释.
主要成果:
- 为N. aviator实现了1.77 Gb的基因组组合,定在21个伪染色体上,N50的支架为102 Mb.
- 确定了19,412个编码蛋白质的基因,具有99.3%的功能注释和高完整性 (96.1%BUSCO).
结论:
- N. aviator的染色体水平参考基因组是研究食肉蝙蝠进化的宝贵资源.
- 这种基因组将有助于了解蝙蝠饮食利基扩张背后的分子机制.


