基于单细胞测序的动脉样硬化PAN-apoptotic免疫相关基因的查和验证

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 遗传学 是一个
• 心血管研究研究心血管研究

背景情况:

• Carotid 动脉样硬化 (CAS) 是系统性动脉样硬化的重要并发症.
• 泛亡是一种炎症编程细胞死亡途径,在疾病发病过程中至关重要.
• 与PANoptosis相关的基因在CAS中的特定作用在很大程度上仍未得到研究.

研究的目的:

• 识别和表征与动脉动脉样硬化相关的与PANoptosis相关的诊断基因 (PORG).
• 根据已识别的PORG开发CAS的诊断模型.
• 探索这些基因在动脉健康中的功能意义.

主要方法:

• 转录组数据分析以确定CAS中的差异表达基因 (DEGs).
• 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 以将基因模块与PANoptosis分数联系起来.
• 机器学习算法 (LASSO回归,随机森林) 用于诊断基因选择和模型构建.
• 单细胞测序,RT-qPCR,以及用于验证的体外实验.

主要成果:

• 在CAS中鉴定了67个与PANoptosis相关的差异表达基因 (POR-DEGs).
• 使用四个关键基因开发诊断模型:CNTN4,FILIP1,PHGDH和TFPI2.2.
• 功能验证证实了这些基因在维持动脉细胞活力和抵抗衰老方面的作用.

结论:

• 四个与PANoptosis相关的新型基因 (CNTN4,FILIP1,PHGDH,TFPI2) 被确定为CAS的潜在诊断标记物.
• 这些发现为针对动脉动脉样硬化治疗的向治疗策略奠定了理论基础.
• 这项研究强调了PANoptosis途径在CAS病变发生过程中的重要性.