在三阴性乳腺癌中识别与免疫相关的预后生物标志物
Xiao-Qing Song1,2, Zhi-Ming Shao1,2
1Key Laboratory of Breast Cancer in Shanghai, Department of Breast Surgery, Fudan University Shanghai Cancer Center, Shanghai, China.
Translational cancer research
|May 13, 2024
概括
一个新的12基因风险评分模型预测了三阴性乳腺癌 (TNBC) 的结果. 这种预后签名可以帮助指导TNBC患者的免疫治疗选择.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫治疗是一种免疫疗法.
背景情况:
- 三阴性乳腺癌 (TNBC) 缺乏用于预后或预测的既定免疫标志物.
- 开发预测框架对于TNBC个性化治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 使用风险评估模型为TNBC创建一个预测框架.
- 确定基因特征,用于预测TNBC的预后和指导免疫治疗选择.
主要方法:
- 使用考克斯回归和LASSO开发了一个风险评分模型,用于FUSCC的360名TNBC患者的RNA测序数据.
- 采用多变量考克斯回归分析来构建预测模型,并与癌症基因组图谱 (TCGA) TNBC队列进行验证.
- 模型性能使用一致性指数和校准图进行评估,ROC曲线评估生存预测.
主要成果:
- 一个12基因的预后签名 (包括*TDO2*, *CHIT1*, *CARML2*, *HLA-C*, *ADIRF*, *C19orf33*, *CA8*, *AHNAK2*, *RHOV*, *OPLAH*, *THEM6*,和 *NEBL*) 被确定.
- 该模型在FUSCC队列中预测1年,3年和5年的生存率具有很高的准确性 (AUC:0.78,0.83,0.75),并使用TCGA数据验证.
- 高风险患者的预后较差,T细胞透率*CD8*+较低. 低风险患者显示免疫检查点基因 (*CD274*, *CTLA4*) 的升高调节,表明潜在的免疫疗法益处.
结论:
- 12基因的预后特征为预测TNBC患者的结果提供了有价值的工具.
- 这种签名可以帮助临床医生选择适合TNBC的免疫治疗策略.
- 这些发现突出了基于这种基因特征的向免疫疗法的潜力.
