对通过定量PCR和滴滴数字PCR选的COVID-19样本组合模式的评估
Daitao Zhang1, Lingyu Shen1, Zhichao Liang1
1Institute for Infectious Disease and Endemic Disease Control, Beijing Center for Disease Prevention and Control, Beijing Research Center for Respiratory Infectious Diseases, Beijing, 100013, China.
Scientific reports
|May 13, 2024
概括
优化SARS-CoV-2 (严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2) 的聚合测试涉及使用集群抽样和10个样本的池大小. 这一战略提高了低风险人群的查效率.
科学领域:
- 分子诊断学 分子诊断学
- 病毒学 病毒学
- 公共卫生准备 公共卫生准备
背景情况:
- 针对SARS-CoV-2的聚合测试对于快速诊断和查至关重要.
- 聚合样本中的测试灵敏度受到各种分析前因素的影响.
- 优化聚合策略对于准确高效的SARS-CoV-2检测至关重要.
研究的目的:
- 通过模拟实验评估不同的标本聚合模式.
- 为了确定SARS-CoV-2检测的最佳聚合策略.
- 评估影响RNA保存和检测灵敏性的因素.
主要方法:
- 模拟实验评估了拭子类型,溶剂吸附,池大小和池容量.
- 使用定量PCR和数字PCR来评估采样性能.
- 通过模拟不同标位的病毒样本来确定检测极限;评估储存条件.
主要成果:
- 与纤维抹布相比,状抹布表现出更高的性能.
- 非无活化病毒溶液显示的RNA保存略好于无活化溶液.
- 一个最佳的聚合策略涉及9毫升总体体积中的10个样本的聚合大小,在4°C或25°C存储至多48小时时的影响最小.
结论:
- 开发的最佳聚合策略实现了与单管试验相当的灵敏度.
- 为低风险人群推,以提高SARS-CoV-2查效率.
- 为未来的呼吸道病原体检测和管理策略提供基础.
