联合宿主-病原体基因组分析识别了与人类NTCP和HLAI类变异相关的B型肝炎病毒突变
Zhi Ming Xu1, Gnimah Eva Gnouamozi2, Sina Rüeger1
1School of Life Sciences, École Polytechnique Fédérale de Lausanne, Lausanne, Switzerland; Swiss Institute of Bioinformatics, Lausanne, Switzerland.
American journal of human genetics
|May 15, 2024
概括
乙型肝炎病毒 (HBV) 演变表明适应宿主压力. 在NTCP受体和HLA-A中的特定遗传变异会影响HBV突变,影响病毒进入和免疫逃避.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 人类遗传学 人类遗传学
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 乙型肝炎病毒 (HBV) 基因组进化可能表明适应宿主选择性压力.
- 了解这些进化动态对于治疗慢性HBV感染至关重要.
研究的目的:
- 研究人类遗传变异和HBV突变之间的基因组对基因组关联.
- 为了确定驱动HBV进化和免疫逃脱的宿主因素.
主要方法:
- 基因组对基因组关联测试使用567名慢性乙型肝炎患者的外体和HBV测序数据.
- 在NTCP-preS1相互作用的in silico建模和体外结合试验.
- 影响HLA类I呈现的HBV突变的in silico分析.
主要成果:
- 在东亚NTCP S267F变种和HBV preS1突变之间发现了显著的关联,增强了NTCP结合.
- 鉴定了HLA-A变异和HLA-A受限制T细胞表观突变之间的关联.
- 致使HBV突变与相关HLA等位基因结合较弱的HBV突变得到了丰富,这表明免疫逃脱.
结论:
- 出现HBV逃生突变,可能会在病毒进入过程中改变NTCP受体结合.
- 主体HLA类I限制驱动HBV表位的变异,有助于病毒的持续性.


