植物基因组学,包括植物浮游植物感染虫的新序列数据,揭示了整个科的多个独立的生活方式过渡
Pauline C Thomé1, Justyna Wolinska2, Silke Van Den Wyngaert3
1Department of Evolutionary and Integrative Ecology, Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Berlin, Germany.
菌被称为菌体经常在寄生和食生活方式之间切换,进化寄生主义多次. 这项研究重建了虫类的进化,表明它们的祖先是植物浮游生物寄生虫.
科学领域:
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 进化生物学 进化生物学
- 细胞的遗传学 细胞的遗传学
背景情况:
- 寄生虫是一种广泛传播的真核生物生活方式,经常在菌体 (Chytridiomycota) 中观察到,早期分支的真菌对生态系统至关重要.
- 虫寄生虫影响宿主种群,特别是导致两动物的减少,并通过终止藻类繁殖来影响碳循环.
- 由于有限的基因组分辨率和对寄生虫血统的稀缺基因组数据,对 chytrids 中寄生虫的进化历史的了解很少.
研究的目的:
- 解决Chytridiomycota属中的寄生虫的进化历史.
- 为了调查寄生虫的多个独立起源和宿主转移在cytrids.
- 为了推断出 chytrid 最后的共同祖先的生活方式.
主要方法:
- 结合的转录组学,培养独立的单细胞基因组学和家族基因组学分析.
- 测序了29个新分离的寄生虫鱼种群.
- 整合了新的数据与现有数据集,以建立一个强大的基因组骨干 Chytridiomycota.
主要成果:
- 建立了一个高分辨率的基因组学框架,用于囊的多样化.
- 确定了寄生虫和食动物生活方式之间的多个独立的进化过渡.
- 记录了大量的宿主转移在囊寄生虫中.
结论:
- 囊类动物的进化特点是生活方式的频繁变化和宿主交换.
- 祖先的虫可能从事寄生,特别针对植物浮游生物.
- 这些发现为真菌寄生虫的进化和早期真菌多样化提供了关键的见解.
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