在CCM2cDNA中失去了异构性,揭示了一个结构变异,导致多个脑洞性形
Annabelle Chaussenot1, Xavier Ayrignac2, Nicolas Chatron3,4
1Department of Medical Genetics, Hôpital de l'Archet 2, CHU de Nice, Nice, France.
European journal of human genetics : EJHG
|May 16, 2024
概括
对大脑洞腔形 (CCM) 的遗传检测可以错过致病变体. 全基因组测序发现了CCM2基因中的新型结构变异,这对于诊断未诊断患者的CCM疾病至关重要.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 神经学 神经学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 大脑洞腔形 (CCM) 是血管异常,通常与CCM1,CCM2或CCM3基因的功能丧失变异有关.
- 标准基因检测,包括DNA测序和复制数变异 (CNV) 分析,未能在约5%的家族性CCM病例中识别致病变体.
研究的目的:
- 为了调查大脑洞穴性形的遗传基础,在一个家庭中,传统的遗传检测产生了负面结果.
- 识别导致CCM疾病的新型遗传机制,超出序列变异和大重组.
主要方法:
- 综合基因分析,包括CCM1,CCM2和CCM3基因的DNA测序.
- 复制数变异 (CNV) 检测和RNA测序.
- 在cDNA上的异构性分析的损失.
- 全基因组测序 (WGS) 用于识别结构变异.
主要成果:
- 传统的基因测试和RNA测序没有揭示三种已知的CCM基因中的致病变体.
- 在受影响的家庭成员的cDNA中检测到CCM2基因中异构性损失.
- 全基因组测序确定了染色体7上一个平衡的结构变异,破坏了CCM2基因并影响了mRNA合成.
结论:
- 在CCM2基因中,一种新的平衡结构变异,无法通过标准方法检测,可以导致家族大脑洞穴性形.
- 全基因组测序对于诊断具有典型多重CCM病变的患者至关重要,因为常规遗传检测无法得出结论.
- 这一发现扩大了CCM疾病的基因变异范围,并突出了WGS在复杂遗传疾病中的有用性.
