在格陵兰的冰盖上有巨大的病毒签名
Laura Perini1, Katie Sipes2, Athanasios Zervas2
1Department of Environmental Science, Aarhus University, Roskilde, 4000, Denmark. laper@envs.au.dk.
Microbiome
|May 17, 2024
概括
在格陵兰的冰雪息地中检测到巨型病毒 (核细胞质大DNA病毒). 这些病毒是活跃的,可以控制导致冰川融化的藻类种群.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 冰川学的冰川学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 冰川上的深色素藻类加速了冰川的融化.
- 病毒,特别是巨型病毒 (核细胞质大DNA病毒 - NCLDV) 在控制这些藻类中的作用尚不清楚.
- 在冰冷的陆地息地中,NCLDV的多样性和功能在很大程度上是未知的.
研究的目的:
- 研究巨型病毒及其在雪和冰中的宿主.
- 确定NCLDV在冰川环境中的多样性和生态作用.
主要方法:
- 从格陵兰岛的各种冰雪息地收集样本 (冷岩,暗冰,冰芯,红/绿雪).
- 种植雪藻的基因组分析.
- 超基因组和超转录组分析以识别病毒标记基因和组装基因组.
主要成果:
- 大多数样本中都发现了巨型病毒标记基因,这些基因在红雪和雪藻基因组中大量存在.
- 在红色和绿色的雪中,元基因组数据显示了来自Imitervirales,Asfuvirales和Algavirales的NCLDV基因组.
- 有证据表明,NCLDV可以感染这些息地的各种藻类和原生菌.
结论:
- 在格陵兰的雪和冰中存在NCLDV标志.
- 巨型病毒转基因组组装基因组 (GVMAGs) 和标记基因在雪藻培养物中被确定,这意味着宿主-病毒关系.
- NCLDV是活跃的,并且可能控制真核藻和原生体,影响冰川生态系统.
