用分子建模分析的关节动物驱除剂与嗅觉受体和离子受体的相互作用

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 昆虫生理学 昆虫生理学
• 计算化学是一种计算化学.

背景情况:

• 昆虫化学受体依赖于嗅觉受体 (OR),味觉受体 (GR) 和离子受体 (IR).
• 对ORs的结构研究表明,连接体结合部位通常被封闭,这就提出了关于分子可访问性的问题.
• 人工智能 (AI) 建模有助于预测蛋白质结构和连接体相互作用.

研究的目的:

• 调查昆虫OR和GR中的联结位点的可访问性.
• 以计算方式测试吸引力和排斥力连接体与这些受体的结合.
• 探索IRs的结合机制,包括潜在的全调节.

主要方法:

• 分子动力学模拟用于分析ORs中的过渡道形成.
• 接软件用于预测与ORs和GRs的配体相互作用.
• 人工智能建模用于生成用于绑定站点分析的IR结构.

主要成果:

• 大多数经过检查的OR和一个GR都存在封闭的连接物结合点,可以通过过渡道进入.
• 预计吸引和排斥的配体,包括DEET,将结合到这些封闭的部位.
• 在封闭状态下,IR连接体结合点是不可访问的;结合可能发生在开放状态下,具有潜在的驱逐剂的全位.

结论:

• 昆虫OR和GR连接物结合点通常被封闭,而道动态控制了访问.
• 像DEET这样的驱逐分子在进入结合部位时可能会遇到固体障碍.
• 国际反射器可能具有调节其功能的全位,提供新的驱逐目标.