对Laiwu和Duroc猪的脂肪组织和肌肉进行转录组分析
Jie Wu1, Fangyuan Yu1, Zhaoyang Di1
1National Engineering Research Center for Breeding Swine Industry, State Key Laboratory of Swine and Poultry Breeding Industry, Guangdong Laboratory of Lingnan Modern Agriculture, Guangdong Provincial Key Laboratory of Animal Nutrition Control, College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510642, China.
Animal nutrition (Zhongguo xu mu shou yi xue hui)
|May 20, 2024
概括
由于脂肪和肌肉组织中明显的基因表达,Laiwu猪的脂肪含量更高. 这项研究确定了参与脂肪沉积的关键代谢途径和基因,为改善猪生产特征提供了目标.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 分子生物学分子生物学
- 畜牧业 生产 畜牧业 生产
背景情况:
- 脂肪含量对于猪生产效率和肉质量至关重要.
- 了解脂肪沉积机制是调节这种特征的关键.
- 中国品种的 Laiwu 猪的脂肪含量高于商业品种的 Duroc.
研究的目的:
- 为了比较Laiwu和Duroc小猪之间的脂肪和肌肉组织的转录组.
- 为了确定差异表达基因 (DEGs) 和关键的调节途径.
- 为了发现调节猪脂肪含量的分子标.
主要方法:
- 从21天大的小猪身上对皮下脂肪组织 (SAT),内脏脂肪组织 (VAT),长大肌肉 (LM) 和psoas肌肉 (PM) 的转录组分析.
- 差异基因表达分析以识别DEGs.
- 功能丰富分析和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建.
主要成果:
- 在SAT中确定了828种DEG,在VAT中确定671种,富含碳水化合物和脂质代谢.
- 在LM中发现312个DEG,在PM中发现335个,在细胞循环和代谢途径中富含.
- 在组织之间确定了潜在的枢纽基因 (例如FBP1,SCD,RRM2,GADL1) 和常见的DEG (例如LDHB,THRSP,DGAT2).
结论:
- 在Laiwu和Duroc小猪之间存在显著的转录组差异,特别是代谢模式.
- 这些差异为Laiwu猪脂肪含量较高的遗传基础提供了洞察力.
- 已识别的基因和通路为猪的遗传改进和脂肪含量调节提供了潜在的目标.
