艾德勒克鲁兹 (Adlercreutzia faecimuris sp.) 是一种有毒的植物. nov.,生产从老鼠便中分离出来的酸和酸

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 细菌学 细菌学是一门学科.
• 肠道微生物组研究研究

背景情况:

• 肠道微生物组在宿主健康中起着至关重要的作用.
• 厌氧细菌是肠道生态系统的关键组成部分.
• 阿德勒克鲁齐亚属包括在宿主新陈代谢中具有已知的作用的细菌.

研究的目的:

• 从小鼠便中分离和描述一种新型无氧细菌.
• 确定该新型隔离物的遗传学和基因组特征.
• 为了对新型细菌进行分类,并确定其在Adlercreutzia属内的分类学位置.

主要方法:

• 从BALB/c小鼠便中分离严格无氧细菌.
• 现型特征: 克拉姆染色,运动性,细胞形状,最佳生长条件 (温度,NaCl,pH).
• 使用16S rRNA基因测序进行的家族遗传学分析.
• 基因组测序和分析 (基因组大小,G+C含量,CDS,rRNA,tRNA基因).
• 使用平均核酸标识 (ANI) 和数字DNA-DNA杂交 (dDDH) 的基因组比较.
• 化学分类学分析:脂肪酸分析 (FAME) 和极性脂质分析.
• 发酵产品的分析.

主要成果:

• 一个新型的严格无氧的,Gram-stain-positive,非运动性棒,菌株JBNU-10,被分离出来.
• 在37°C,1%的NaCl和pH7下,生长最佳.
• 遗传学分析将JBNU-10菌株置于Adlercreutzia属内,与Adlercreutzia muris密切相关 (95.90%的16SrRNA基因序列相似性).
• 基因组大小为2,790,983 bp,DNA G+C含量为69.4 mol%,含有2,266个CDS,5个rRNA和49个tRNA基因.
• 较低的ANI (<77.6%) 和dDDH (<23.8%) 值表明了不同的物种状态.
• 主要脂肪酸包括iso-C16:0 DMA,C18:1 cis 9 FAME和C18:0 DMA;极性脂质是DMMK-6.
• 主要发酵的最终产品是酸和酸盐.

结论:

• 菌株JBNU-10代表了Adlercreutzia属内的新物种,基于遗传学,生理学和化学分类学数据.
• 这种新型细菌的表征有助于了解无氧肠道细菌及其生态作用.
• 为这种新物种提出了JBNU-10类型菌株 (KCTC 25028 = CCUG 75610).