使用转录基因值计数量化干细胞衍生的心肌细胞成熟度的协议
Elaine Zhelan Chen1, Suraj Kannan1, Sean Murphy1
1Division of Cardiology, Department of Medicine, Johns Hopkins School of Medicine; Baltimore, MD, USA; Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins School of Medicine; Baltimore, MD, USA; Department of Cell Biology, Johns Hopkins School of Medicine; Baltimore, MD, USA; Institute for Cell Engineering, Johns Hopkins School of Medicine; Baltimore, MD, USA.
STAR protocols
|May 23, 2024
概括
量化心肌细胞成熟对于干细胞研究至关重要. 从单细胞RNA测序中获得的新型"分"指标,提供了一种可靠的方法来测量干细胞衍生的心肌细胞成熟度.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 量化心肌细胞 (CM) 成熟是干细胞研究的一个重大挑战.
- 目前的方法不足以评估从多能干细胞 (PSC) 产生成人类CM的有效性.
研究的目的:
- 引入一种用于量化干细胞衍生CM成熟度的新方案.
- 建立基于单细胞RNA测序的指标,即"分数",用于评估CM成熟度.
主要方法:
- 开发一种使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 的协议.
- 实现定制的R代码以生成"分数".
- 应用分数来量化PSC衍生CM中的成熟度水平.
主要成果:
- 一个新的指标,即"得分",已被开发来量化CM成熟度.
- 该协议可以客观地测量干细胞衍生的CM成熟度.
- 分数显示了超越PSC-CMs对其他细胞类型的应用潜力.
结论:
- 开发的分数为量化心肌细胞成熟提供了一种可靠的方法.
- 这种基于scRNA-seq的指标有助于评估干细胞分化协议.
- 分数为评估不同细胞类型的细胞成熟度提供了一种多功能工具.
