构建一个TAN相关风险评分模型,集成多omics数据分析和胃癌临床验证
Zhangdi Xu1, Lan Zhang2, Xiaping Wang3
1National Clinical Research Center for Hematologic Diseases, Jiangsu Institute of Hematology, The First Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou 215006, China.
Life sciences
|May 23, 2024
概括
这项研究开发了一种新的瘤关联中性粒细胞 (TAN) 相关风险评分 (TRS) 模型,以预测癌症预后和治疗反应. 该TRS有效地识别了TAN作为瘤微环境中的关键因素,以指导治疗策略.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 中性粒细胞激活和偏振在瘤进展中起着重要作用.
- 瘤关联中性粒细胞 (TAN) 是瘤微环境的关键组成部分,但它们的表征仍然有限.
研究的目的:
- 开发和验证TAN相关风险评分 (TRS) 模型,用于泛癌的预后预测.
- 研究TANs在胃癌 (GC) 中的作用及其与瘤免疫细胞透和通路的相关性.
主要方法:
- 使用TCGA,GEO和IMvigor210数据库进行表达式配置文件.
- 采用加权基因共同表达网络分析 (WGCNA) 和RNA-seq来建立TRS模型.
- 在使用免疫组织化学 (IHC) 的117名GC患者的临床队列中验证了TRS模型.
主要成果:
- 开发了一个10基因TAN相关风险评分 (TRS) 签名,在GC微环境TAN中丰富.
- 该TRS模型准确地预测了患者的预后和对化疗和免疫治疗的反应.
- 确定了TANs作为GC的独立预后因素,与前瘤免疫细胞和免疫抑制途径相关.
结论:
- 新的TRS模型对GC和癌的预后预测有价值.
- 进一步评估TRS和TAN可以提高对瘤微环境的理解,并为治疗策略提供信息.
