乙醇与OMNImet/基因的比较代谢和微生物组分析•GUT便稳定
Heidi Isokääntä1, Lucas Pinto da Silva2, Naama Karu3
1Research Center for Infections and Immunity, Institute of Biomedicine, University of Turku, Kiinamyllynkatu 10, 20520 Turku, Finland.
Analytical chemistry
|May 23, 2024
概括
在室温下将便样本储存在95%乙醇 (EtOH) 中,可提供稳定的便代谢和微生物组概况,与冷相当. 这种方法支持肠道微生物组研究,当立即冷是不可能的.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 胃肠病学 胃肠病学
背景情况:
- 便代谢物提供了关于肠道微生物组功能的见解.
- 在肠道微生物组研究中,立即结样本并不总是可行的.
- 需要在室温下使用稳定的采样协议.
研究的目的:
- 用95%乙醇 (EtOH) 和商业套件在室温下研究便代谢物和微生物组的稳定性.
- 为了比较室温储存与标准 -80°C冷用于便样本分析.
主要方法:
- 便样本被储存在95%EtOH,OMNImet•GUT/OMNIgene•GUT套件中,或在-80°C处快速冷.
- 样品被存储在不同的时间 (24小时-7天) 和温度 (+4°C,室温).
- 针对性和非针对性的代谢分析分析了脂质,极性代谢物,内分泌素,SCFA和BA;16SrRNA测序评估了微生物组合.
主要成果:
- 短链脂肪酸 (SCFA) 在室温95%EtOH和OMNImet•GUT样本中保持稳定.
- 在比较室温和+4°C储存时,胆酸 (BAs) 和SCFA显示出变化.
- 微生物组组成在很大程度上不受储存类型的影响,但α多样性不同.
- 95%的EtOH储存产生了与快速冷相比较的代谢结果.
结论:
- 在室温95%乙醇中储存便样本可确保代谢组的稳定性,与快速冷相美.
- 95%乙醇为肠道微生物群和代谢组样本的保存提供了一个可行的替代方案,当立即冷是不可能的.
- 商业套件OMNImet•GUT和OMNIgene•GUT也表现出良好的样品保存能力.
