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Updated: Jun 26, 2026
09:37
Screening Foodstuffs for Class 1 Integrons and Gene Cassettes
Published on: June 19, 2015
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从安第斯共同体国家报告的Escherichia coli全基因组序列中检测1类整体及其可变区域
María Nicole Solis1, Karen Loaiza2, Lilibeth Torres-Elizalde3
1Facultad de Ciencias Médicas Enrique Ortega Moreira, Carrera de Medicina, Universidad Espíritu Santo, Samborondón 092301, Ecuador.
Antibiotics (Basel, Switzerland)
|May 24, 2024
概括
1类整合子在大肠杆菌中广泛存在,有助于各种来源的抗菌素耐药性. 这项研究揭示了这些耐药基因的多样性和流行率比以前知道的要大.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 抗菌素耐药性 (AMR) 是一个日益增长的全球健康威胁.
- 集成子,特别是1类集成子,是已知的有助于AMR的遗传元素.
- 之前的研究发现了来自安第斯社区的大肠杆菌中的1类整体,但缺乏有关基因盒的详细信息.
研究的目的:
- 在大肠杆菌分离物中研究1类整体和它们的基因盒的存在和多样性,采用大规模的in silico方法.
- 分析带有整体子的大肠杆菌的起源和关联.
- 了解由整子携带的抗微生物耐药性基因的景观.
主要方法:
- 利用了EnteroBase.中可用的2533个大肠杆菌分离物的全基因组测序数据.
- 使用IntFinder v1.0工具进行整子的in silico识别.
- 分析了已识别的整子的变量区域内的基因磁带.
主要成果:
- 在近三分之一的分析的大肠杆菌分离物中检测到1类整体子.
- 在所有研究的国家中,具有整体子的分离物来源于环境,食品,人类和动物来源.
- 鉴定的整体体携带各种基因盒,对氨基糖化物 (aadA),三甲 (dfrA),化物 (blaOXA, blaDHA) 和化 (aac(6') -Ib-cr, qnrB) 产生抗性.
- 观察到更高的多样性和比以前报告的更多的基因盒子,包括具有超过三个盒子的整体.
结论:
- 1类整合子在大肠杆菌中普遍且多样化,作为抗菌素耐药性基因的重要储存库.
- 这些发现凸显了对基因元素如整子的持续监测的必要性,以追踪致病细菌中新出现的耐药性模式.
- 了解整体的多样性对于制定有效的抗抗微生物药物耐药性策略至关重要,尤其是在有利于耐药性选择的因素地区.
