菌的基因组挖掘 独特的三二烯合成酶类似的基合成酶
Zhanren Cong1, Qiang Yin1, Kunhong Tian1
1State Key Laboratory of Bioreactor Engineering, East China University of Science of Technology, Shanghai 200237, China.
Journal of fungi (Basel, Switzerland)
|May 24, 2024
概括
研究人员发现了一种新的真菌甲合成酶 (STSs) 家族,称为三二烯合成酶类甲合成酶 (TDTSs). 这一发现扩大了天然产品药物发现,通过识别来自真菌的新型酶和化合物.
科学领域:
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 生物化学 生物化学
- 自然产品 化学 化学
背景情况:
- 类对于天然产品药物发现至关重要.
- 基因组挖掘已经确定了新型的甲和酶,但真菌甲合成酶 (STSs) 仍未完全表征.
研究的目的:
- 综合分析真菌STS并确定用于药物发现的新型酶.
- 探索一种新发现的真菌特异性STS家族的潜力.
主要方法:
- 对123种真菌STS进行了家族遗传学分析,以确定三二烯合成酶类似的二烯合成酶 (TDTS) 家族.
- 隐藏的马尔科夫模型从真菌基因组库中发现517个TDTS.
- 序列相似性网络将TDTS分为79个家族.
- 在Aspergillus oryzae中选择23个TDTS基因的异质表达.
主要成果:
- 发现了一种真菌特异性的STS家族,TDTSs,发现了517名成员.
- 10个活跃的TDTS的功能特征,产生12个新型单和六烯.
- 发现了第一个chamipiene合成酶和第一个由真菌衍生的cedrene,sabinene和camphene合成酶.
- 具有特定基烯结构的TDTS家族的相关性 (例如,家族1产生桥式环形基烯,家族2产生螺旋和桥式环形基烯).
结论:
- 这项研究确立了TDTSs作为一种重要的真菌六二烯合成酶家族.
- 这项工作提供了一个新的策略,用于真菌的基因组开采,促进天然产品药物发现.
- 已识别的TDTS及其产品为制药开发提供了潜在的线索.
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