MSGD:手工策划的基因组,转录基因组,蛋白质基因组和多发性硬化症药物信息数据库

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 遗传学 是一个遗传学.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 多发性硬化症 (MS) 是中枢神经系统的一种流行性炎症性脱髓化疾病.
• "奥米克"数据 (基因组学,转录组学,蛋白质组学) 对于了解多发性硬化症至关重要,但在文献中是分散的.
• 现有的数据可访问性挑战阻碍了MS研究的全面分析和利用.

研究的目的:

• 开发一个集中,精心策划的数据库,用于与多发性硬化症相关的"omics"和药物信息.
• 为研究人员提供一个用户友好的平台,访问,分析和贡献与MS相关的遗传和分子数据.
• 为了促进基因机制的破译,并改善多发性硬化症的预防,诊断和治疗.

主要方法:

• 手动挖掘和编译来自5485个科学出版物的数据.
• 构建多发性硬化症基因数据库 (MSGD),详细输入.
• 开发一个用户友好的网络界面来搜索,查看和提交数据.

主要成果:

• 目前MSGD包含6255条条目,包括变体,RNA,蛋白质,淘汰赛,药物和高通量数据.
• 每个条目提供了全面的细节,如物种,疾病类型,基因描述和参考.
• 该数据库提供了用于基因搜索,表达模式查看,基因组管理和新协会提交的功能.

结论:

• 该MSGD作为一个有价值的,可访问的多发性硬化症研究资源.
• 通过整合分散的数据,MSGD旨在降低数据解释和利用的障碍.
• 预计这一举措将大大推进有关多发性硬化病原和治疗策略的研究.