使用VolTRAX自动化图书馆准备平台快速检测和快速描述非洲猪瘟病毒
Vivian O'Donnell1, Jim L Pierce2, Oleg Osipenko3
1Plum Island Animal Disease Center, Animal and Plant Health Inspection Service, U.S. Department of Agriculture, Foreign Animal Disease Diagnostic Laboratory, National Veterinary Services Laboratories, Orient, NY 11957, USA.
Viruses
|May 25, 2024
概括
使用牛津纳米孔的自动化DNA库准备.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 基因组测序是指基因组的测序.
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 非洲猪瘟病毒 (ASFV) 在猪中引起一种高度传染性和致命的疾病.
- 亚洲猪瘟疫情严重影响全球猪产量和国际贸易.
- 快速检测ASFV对于疾病制至关重要.
研究的目的:
- 评估牛津纳米孔技术公司的VolTRAX平台,用于自动化DNA库准备.
- 评估使用VolTRAX和纳米孔测序快速识别ASFV菌株的可行性.
主要方法:
- 使用VolTRAX平台对ASFV进行自动化DNA库准备.
- 在纳米孔测序平台上的下游测序 (MinION Mk1C和GridION).
- 对用于ASFV识别的近全基因组序列的分析.
主要成果:
- 沃尔特拉克斯能够在几分钟内快速为ASFV准备DNA库.
- 快速获得了近乎完整的ASFV基因组序列.
- 自动化工作流证明了ASFV检测的有效性.
结论:
- 沃尔特拉克斯平台是自动化图书馆准备的有效工具.
- 这种自动化方法有助于快速和实时检测ASFV.
- 工作流适用于现场 (MinION) 和实验室 (GridION) 设置.


