临床乳腺炎相关的Enterococcus faecalis和Enterococcus faecium的基因组序列草案携带从奶牛中分离的多个抗菌素耐药性基因

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 兽医科学 兽医科学 兽医科学

背景情况:

• Enterococcus faecalis和Enterococcus faecium的抗菌素耐药性在牲畜中是一个日益关注的问题,导致严重的经济损失.
• 牛乳炎相关的肠球菌感染对动物健康和潜在的食品供应构成威胁.

研究的目的:

• 报告孟加拉国乳腺炎感染的奶牛中分离出的Enterococcus faecalis和Enterococcus faecium菌株的基因组序列草案.
• 分析这些菌株的抗微生物耐药性和毒性基因.
• 为研究畜牧业相关的Enterococci提供基因组参考.

主要方法:

• 从原牛奶样本中分离和识别菌株.
• 使用Illumina NextSeq 550平台进行全基因组测序.
• 对抗病毒因子,抗微生物耐药性基因和多位序列类型 (MLST) 的组装结合体的生物信息分析.
• 与现有的Enterococcus基因组进行比较基因组学和遗传学分析.

主要成果:

• E. faecalis BR-MHR218Efa (MLST ST-190) 菌株具有十个抗微生物耐药性基因和两个与粘附相关的毒性基因.
• E. faecium BR-MHR268Efe (MLST ST-22) 菌株携带了一个宏化物耐药性基因和八个毒性操作子,包括粘附和生物膜形成的操作子.
• 这两种菌株都代表相对罕见的序列类型,突出显示出独特的遗传特征.

结论:

• 这些基因组序列为乳腺炎相关的Enterococci分子流行病学提供了宝贵的参考资料.
• 这些发现有助于理解牲畜相关的菌菌体中复杂的抗微生物耐药机制.
• 这项研究增强了对动物健康相关的Enterococcus菌株毒性和耐药性的遗传基础的知识.