选择稳定的基因参考基因的qPCR表达的Colletotrichum lindemuthianum,豆炭菌的病原体

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 菌类学 菌类学是指菌类学.

背景情况:

• 常见豆 (Phaseolus vulgaris L.) 是一个重要的作物,受到炭病的威胁,这是一种由Colletotrichum lindemuthianum引起的疾病.
• 了解C. lindemuthianum病原性的分子基础对于疾病管理至关重要.
• 准确的基因表达分析,特别是毒性因子,需要可靠的参考基因进行正常化.

研究的目的:

• 在C. lindemuthianum.中进行定量基因表达研究的稳定参考基因的识别和验证.
• 为调查常见豆类感染期间的致病性基因表达提供必要的工具.

主要方法:

• 从C. lindemuthianum基因组中选择了八个候选参考基因.
• 证实了原料的特异性和qPCR的效率.
• 在使用GeNorm,NormFinder,BestKeeper和RefFinder算法在九个压力条件下评估了基因表达稳定性.

主要成果:

• 候选基因的原始检测结果显示了病原体的特异性.
• 延长因子 (EF),甘甲基-3-酸脱酶 (GAPDH) 和β-管素 (β-tub) 被确定为最稳定的参考基因.
• 动氨酸 (ACT) 和氨酸合成酶1 (CHS1) 的表达稳定性较低.

结论:

• 已验证的参考基因 (EF和GAPDH) 现在可用于C. lindemuthianum基因表达研究.
• 这些稳定基因将在宿主感染期间促进对效应基因表达的准确分析.
• 这项研究支持了解和控制豆类炭菌的努力.