植物MASST - - 由社区推动的植物化学分类学数字化
Paulo Wender P Gomes1,2, Helena Mannochio-Russo1,2, Robin Schmid1,2,3
1Collaborative Mass Spectrometry Innovation Center, Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|May 27, 2024
概括
我们创建了plantMASST,这是一个新的植物代谢物数据库,来自19075个提取物. 这个资源有助于探索植物分子,使用质谱测量来发现药物和理解植物进化.
科学领域:
- * 代谢学 代谢学
- * 生物信息学是一门学科.
- * 植物科学 植物科学
背景情况:
- * 植物代谢物的巨大多样性给理解它们的分布带来了挑战.
- * 探索植物性分子需要高效的数据管理和分析工具.
研究的目的:
- * 开发一个全面的,以分类学为重点的植物代谢物数据库.
- * 为了促进植物衍生分子的探索和分析,使用双重质谱 (MS/MS) 光谱.
- * 支持药物发现,生物合成, (化学) 分类学和进化生态学的研究.
主要方法:
- * 精选的公开可用的液体染色学-双重质谱 (LC-MS/MS) 数据.
- * 开发了plantMASST参考数据库.
- *包括来自246个植物家族,1469个属和2793个物种的19075种植物提取物的数据.
主要成果:
- * 植物MASST数据库为植物代谢物探索提供了宝贵的资源.
- * 数据库允许分析MS/MS光谱以识别植物性分子.
- * 促进植物化学多样性的分类学和进化研究.
结论:
- * 植物MASST是植物代谢学研究的重大进展.
- * 数据库支持各种应用,包括药物发现和生态研究.
- * 提高了研究植物化学多样性和进化的能力.
