时钟依赖的染色质可访问性节奏调节昼夜转录.
Ye Yuan1, Qianqian Chen2, Margarita Brovkina1
1Cellular and Molecular Biology Program, University of Michigan, Ann Arbor, Michigan, United States of America.
德洛索菲拉时钟神经元中的染色质可访问性节奏对于昼夜基因调节至关重要. 周期蛋白驱动着染色质的紧缩,这对于每日生物定时是必不可少的.
科学领域:
- 时间生物学 时间生物学
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 循环节律由时钟蛋白调节,但染色质组织的作用尚不清楚.
- 了解DNA可访问性如何影响日常基因表达模式至关重要.
研究的目的:
- 为了研究Drosophila时钟神经元在昼夜循环中的全基因组染色质可访问性动态.
- 阐明染色体结构和时钟蛋白在调节基因表达中的功能之间的关系.
主要方法:
- 用测序 (ATAC-seq) 检测转化酶可访问染色体的测试是在排序的多虫时钟神经元上进行的.
- 在黎明和黄昏时评估染色素可访问性,以捕捉昼夜波动.
- 分析可访问地区的图案丰富,以确定监管要素.
主要成果:
- 在数百个基因促进器和增强器区域观察到染色质可访问性的显著波动.
- 带有黄昏可访问染色质的基因显示为E盒动图 (PER/CLK循环) 的丰富,而清晨可访问的基因具有VRI/PDP1盒动图 (VRI/PDP1循环).
- 对于01个无基因突变者,染色质可访问性节奏完全丧失,这表明周期蛋白在染色质紧缩中的作用.
结论:
- 染色体组织是昼夜调节的一个重要因素,由时钟蛋白和染色体结构调节.
- 时钟蛋白和染色质之间的相互作用决定了日常生物过程的精确时间.
- 染色质可访问性的变化可能会导致时钟神经元中的各种昼夜基因表达模式.
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